У коллетотрихума есть и паразитический штамм, который называется Ct3. Он мешает растению всасывать питательные вещества, стимулирует синтез ингибиторов роста и в итоге тормозит рост растения.
Кей Хирума с соавторами выяснили, что патогенность штамма Ct3 контролирует всего один кластер генов.